Selain untuk kebutuhan PLTA dan PDAM, Perum Jasa Tirta I juga memberikan layanan penyediaan air baku untuk kelompok pemanfaat di sektor industri. Sebagaimana dijelaskan pada Peraturan Menteri PUPR No. 18/PRT/M/2015 pasal 5 bahwa jenis usaha yang dikenakan BJPSDA dibagi berdasarkan peruntukannya, diantaranya adalah kelompok industri. Tarif BJPSDA untuk kelompok industri ditetapkan oleh Pemerintah secara progresif, disesuaikan dengan besaran debit pengambilan air permukaan yang dibaca pada intake pengguna.

Setiap pengguna air permukaan wajib memiliki Izin Penggunaan Sumber Daya Air (IPSDA) yang diterbitkan oleh Menteri Pekerjaan Umum Dan Perumahan Rakyat (PUPR). Mekanisme dan persyaratan permohonan izin diatur dalam Peraturan Menteri PUPR No. 01/PRT/M/2016 tentang Tata Cara Perizinan Pengusahaan Sumber Daya Air Dan Penggunaan Sumber Daya Air.

Pemanfaat industri antara lain meliputi Pabrik Gula, Industri Kertas, Semen, Pupuk, dan pertambangan dan lain sebagainya. Di Wilayah Brantas terdapat 145 pemanfaat kelompok industri, Wilayah Bengawan Solo terdapat 30 pemanfaat, dan di Wilayah Sungai Jratun Seluna dan Serayu Bogowonto terdapat 21 pemanfaat.